明朝时期被列为禁书的书籍有很多，其中一些著名的包括：
《金刚经》：由于佛教的传播和影响，明朝时期禁止了佛经的传播和阅读，其中包括了《金刚经》。
《葵花宝典》：据传是明朝抗倭名将俞大猷所编的一部军事秘籍，内容极为残酷和血腥，因此被列为禁书。
《红楼梦》：虽然现在《红楼梦》被认为是中国文学的经典之作，但在明朝时期，由于涉及到宫廷斗争和官场腐败等敏感问题，被列为禁书。
《西游记》：与《红楼梦》一样，虽然现在《西游记》被广泛阅读和传播，但在明朝时期，由于其涉及佛教和道教的神话故事，被认为是迷信和邪教，因此被列为禁书。
《水浒传》：《水浒传》也是明朝时期被列为禁书的一部作品。由于其涉及盗匪和反叛，可能会引发社会动荡和不安定因素，因此被认为是不良读物。
需要注意的是，这些书籍被列为禁书并不是因为它们本身就是邪书，而是因为它们的内容可能引发社会不稳定和政治动荡等问题，因此被禁止传播和阅读。